学术课程
AP 研讨会
AP 英语文学
AP 英语语言
AP 世界历史
AP 欧洲历史
AP 美国历史
AP 美国政府
AP 宏观经济学
AP 微观经济学
AP 心理学
AP 微积分
AP 统计学
AP 高等化学
AP 高等生物学
AP 物理
AP 环境科学
AP 计算机科学
AP 音乐理论
绘画实验
摄影入门
英语 9
英语 10
英语 11
英语 12
大学一年级写作
英国文学研究
运动医学入门
代数
几何
代数 II/三角函数
初级微积分
统计学
大学微积分 I
大学微积分 II
地球科学
生物
化学
物理
生物学基础 I
生物学基础 II
全球历史和地理学
美国历史与政府
社会学入门
社会学
西班牙语 V
高级西班牙语
与圣约翰大学等合作开设：
英语说明文写作
英国文学研究
社会学导论
社会问题研究
西班牙语
中级西班牙语对话
统计学
预科微积分
大学代数
微积分入门
大学微积分 I
大学微积分 II
生物学基础 I
生物学基础 II
运动医学
体育活动
PLTW精英工程学项目
学校与美国STEM教育最重要课程提供者Project Lead the Way（简称为“PLTW”）合作开设工程学课程，该项目遵循动手实践、注重实际的学习方法。
在为期四年的项目中，学生学习和运用设计过程，提升团队协作和沟通技巧，并学会批判性思考。此外，学生还有机会修读罗彻斯特理工学院的大学学分课程。
GENESIS 科研项目
GENESIS项目，在传统课堂教育之外，为学生提供一个机会，追求他们有激情或兴趣的研究领域。 学生将与学校项目主任和项目导师合作，在自己感兴趣的领域设计GENESIS项目，将他们的热情和科学方法结合到真实的生活体验中。 项目导师可能是SJB的老师、大学教授或研究领域的专业人士，他们可以与学生分享自己的兴趣和专业知识。
参与GENESIS项目的学生将在一个具有挑战性的、支持性的、高科技的环境中学习和工作，学生将在以下方面发展自己的能力和技能: 21世纪的技术，写作、演讲和沟通，项目管理、时间管理和领导力，研究方法与科学方法，统计学:数学和统计学的应用。
当地医院合作项目
圣约翰高中与长岛当地的Good Samaritan Hospital达成合作关系，成立“We Care”项目。每周一天的放学后，参与项目的学生步行到旁边的医院，由医院的医生或职工为学生提供主题讲座或是实操医学演示。
讲座主题包括：《癌症研究》、《人类资源》、《社区健康卫生》、《手术室和护理》、《食物营养和服务》、《医学教育》等。
学生还有机会看到止血、抽血、显微镜观察等实操演示。
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